Gaussian

Gaussian是一个功能强大的量子化学综合软件包。

安装Gaussian

step 1. 获取安装包到HOME目录；

step 2. 解压并安装；

cd ~
tar xf g16a03.tbz
cd g16
./bsd/install

step 3. 创建tmp文件夹用于计算时产生的临时文件;

mkdir ${HOME}/tmp

step 4. 设置运行时候的环境变量，必要的话，将其写入到bashrc中；

export g16root=${HOME}
export GAUSS_SCRDIR=${HOME}/tmp
source $g16root/g16/bsd/g16.profile

2. 提交作业

step 1. 创建作业工作目录；

mkdir g16JOb1
cd g16JOb1

step 2. 上传运行样例需要的文件到该文件夹，比如说要处理的文件为Product_1_MeSH.gjf；

step 3. 在该文件夹下编写作业脚本Job1.sh，内容如下；

#!/bin/bash  
#SBATCH -o slurm.%j.%N.out    
#SBATCH --partition=C032M0128G    
#SBATCH -J testg16
#SBATCH -N 1 
#SBATCH --ntasks-per-node=32
#SBATCH --get-user-env 

g16 Product_1_MeSH.gjf

step 4. 提交作业；

sbatch Job1.sh