交互式作业-RStudio
可以选择启动 Conda 版本的 Rstudio,也可以选择启动系统内置的 Rstudio,推荐使用前者,因为后者在安装 R 包的时候,很可能安装失败
启动 Conda 版本 RStudio
第一步:通过 Conda 安装 R 语言环境:
# 加载 conda,如果没有 conda,可以通过以下指令加载,已有 conda 则不需要加载
module load anaconda/3.7.1 # 未名一号为例
# 通过conda创建R语言环境 conda_name 需用户自行定义
conda create -n conda_name r=4.3 -y
# 进入上一步创建好的虚拟环境;
source activate myEnvR
# 安装R语言库,比如stringi
conda install r-stringi
第二步:在导航栏选择 交互式应用 并选择相应集群,点击 创建应用,之后在应用列表中选择 RStudio(Conda版本) 来创建应用
第三步:在交互式应用创建页面,输入程序运行使用的作业名、账户、分区、QOS、节点数、单节点CPU核心数、最长运行时间、Module环境名、Conda环境名,点击 提交
第四步:刷新 已创建的应用 页面,当刚才创建的应用后面的 连接 为可点击状态时,点击 连接 即可连接 RStudio
第五步:在导航栏选择 交互式应用 并选择相应集群,点击 已创建的应用 ,即可查看已开启的可视化应用
推荐使用下述方式进行conda的安装,速度快且不需连接校外网络:
- Conda: https://mirrors.pku.edu.cn/Help/Anaconda
启动系统内置 RStudio
第一步:在导航栏选择 交互式应用 并选择相应集群,点击 创建应用,之后在应用列表中选择 RStudio 来创建应用
第二步:输入程序运行使用的作业名、账户、分区、QOS、节点数、单节点CPU核心数、最长运行时间、RStudio版本、R版本,点击 提交
第三步:刷新 已创建的应用 页面,当刚才创建的应用后面的 连接 为可点击状态时,点击 连接 即可连接 RStudio
第四步:在导航栏选择 交互式应用 并选择相应集群,点击 已创建的应用,即可查看已开启的可视化应用