使用流程
第一步: 账号获取
根据不同需求,选择教学集群或科研集群,具体查看账号申请。
第二步:登录集群
登录集群的方式有两种,一种是使用 SCOW 可视化平台网页的方式登录使用集群;一种是使用 SHELL 客户端登录集群。
SCOW 平台使用统一认证方式进行验证,访问和使用方式参考 SCOW 使用文档
SHELL登录需要先绑定OTP,通过OTP码 + 密码方式登录(密码为开户使用的门户密码)。
注意
使用公共账号开通上机账号的用户,暂不支持SCOW可视化平台的登录使用。
第三步:使用软件
方式一,通过 module 命令,加载平台预先安装的部分软件;
方式二,通过 conda 安装和管理Python、R、生信这类软件环境;
方式三,通过 singularity 使用容器方式安装使用软件;
当然也可以自行将软件编译到自己的家目录(HOME目录)中。具体查看软件使用。
第四步:提交作业
登录集群后,所在的节点是登录/数据传输节点,并不能执行任务,需要通过作业调度系统,将作业提交到计算节点执行。
具体步骤为编写作业脚本,并通过sbatch
将作业提交到集群。
提交后还可以使用squeue
, scontrol show job <job id>
, scancel
等进行作业的查看、取消等操作。